mercredi 12 octobre 2016

Heures événement  
09:45 - 10:00 Introduction  
10:00 - 11:00 Tutoriel : Learning ecological networks – benefits and perspectives - Dave Bohan, UMR Agroecologie INRA Dijon  
11:00 - 11:30 Pause  
11:30 - 12:30 Tutoriel : apprentissage de réseaux biologiques - Guillem Rigaill, SPS Paris Saclay  
12:30 - 14:00 Repas puis Discussion libres / AG AIGM  
14:00 - 15:00 Sobol sensitivity analysis. Recent statistical result overview. Kick and follow for network construction - Fabrice Gamboa - Université Paul Sabatier, Toulouse  
15:00 - 15:30 Pause  
15:30 - 17:00 Travaux génériques / Applications / Nouvelles questions  
15:30 - 16:00 › Learning the structure of kelp forest ecological network - Etienne Auclair, Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse  
16:00 - 16:30 › Impact de l'échantillonnage sur l'inférence de structure dans les réseaux - Timothée Tabouy, Mathématiques et Informatique Appliquées, Paris-Saclay  
16:30 - 17:00 › Inférence et clustering de graphes pour l'exploration du microbiote intestinal humain - Hanna Julienne, MetaGénoPolis, INRA, Université Paris-Saclay  

jeudi 13 octobre 2016

Heures événement  
09:00 - 10:00 Tutoriel : statistique et apprentissage de réseau - Julien Chiquet, UMR AgroParisTech INRA MIA Paris  
10:00 - 10:30 Pause  
10:30 - 12:30 Travaux génériques / Applications / Nouvelles questions  
10:30 - 11:00 › Inférence de réseaux parcimonieux en présence de variables inobservées - Geneviève Robin, Mathématiques et Informatique Appliquées, AgroParisTech  
11:00 - 11:30 › Réseaux d'associations au sein de communautés bactériennes : Inférence de réseaux et distribution en loi de puissance de l'abondance des espèces - Arnaud Cougoul, Unité d'Epidémiologie Animale, Clermont-Ferrand-Theix  
11:30 - 12:00 › Modélisation Bayésienne de réseaux Biologiques - Ghislaine Gayraud, Laboratoire de Mathématiques Appliquées de Compiègne  
12:00 - 12:30 › Régression binomiale négative avec termes d'interaction: un modèle pour étudier le lien entre protéines et boucles ADN - Raphaël Mourad, Laboratoire de biologie moléculaire eucaryote du CNRS, Toulouse  
12:30 - 14:30 Repas puis Discussions libres / AG MOABI-NETBIO-AIGM  
14:30 - 15:30 Tutoriel : Méthodes exactes d'optimisation pour l'apprentissage de la structure de réseaux Bayésiens en vue de reconstruire des réseaux de régulations de gènes - Simon de Givry, MIAT INRA Toulouse  
15:30 - 16:00 Pause  
16:00 - 17:00 Learning microbial networks from NGS data: a case example - Corinne Vacher, BIOGECO INRA Bordeaux  

vendredi 14 octobre 2016

Heures événement  
09:00 - 10:00 Dynamic optimization of metabolic networks coupled with gene expression - Alexander Bockmayr, Freie Universität Berlin
 
10:00 - 11:00 Travaux génériques / Applications / Nouvelles questions  
10:00 - 10:30 › Exact Bayesian inference for off-line change-point detection in tree-structured graphical models - Loïc Schwaller, AgroParisTech  
10:30 - 11:00 › Identification of deregulated transcription factors in bladder cancer - Magali CHAMPION, Laboratoire de Mathématiques Appliquées, Paris 5  
11:00 - 11:30 Pause  
11:30 - 12:30 Inferring and analysing the gene regulatory networks involved in plant root development - Soazig Guyomarch, Université de Montpellier  
12:30 - 13:30 Repas (picnic, sur place ou à emporter)