mercredi 12 octobre 2016
Heures | événement | |
09:45 - 10:00 | Introduction | |
10:00 - 11:00 | Tutoriel : Learning ecological networks – benefits and perspectives - Dave Bohan, UMR Agroecologie INRA Dijon | |
11:00 - 11:30 | Pause | |
11:30 - 12:30 | Tutoriel : apprentissage de réseaux biologiques - Guillem Rigaill, SPS Paris Saclay | |
12:30 - 14:00 | Repas puis Discussion libres / AG AIGM | |
14:00 - 15:00 | Sobol sensitivity analysis. Recent statistical result overview. Kick and follow for network construction - Fabrice Gamboa - Université Paul Sabatier, Toulouse | |
15:00 - 15:30 | Pause | |
15:30 - 17:00 | Travaux génériques / Applications / Nouvelles questions | |
15:30 - 16:00 | › Learning the structure of kelp forest ecological network - Etienne Auclair, Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse | |
16:00 - 16:30 | › Impact de l'échantillonnage sur l'inférence de structure dans les réseaux - Timothée Tabouy, Mathématiques et Informatique Appliquées, Paris-Saclay | |
16:30 - 17:00 | › Inférence et clustering de graphes pour l'exploration du microbiote intestinal humain - Hanna Julienne, MetaGénoPolis, INRA, Université Paris-Saclay |
jeudi 13 octobre 2016
Heures | événement | |
09:00 - 10:00 | Tutoriel : statistique et apprentissage de réseau - Julien Chiquet, UMR AgroParisTech INRA MIA Paris | |
10:00 - 10:30 | Pause | |
10:30 - 12:30 | Travaux génériques / Applications / Nouvelles questions | |
10:30 - 11:00 | › Inférence de réseaux parcimonieux en présence de variables inobservées - Geneviève Robin, Mathématiques et Informatique Appliquées, AgroParisTech | |
11:00 - 11:30 | › Réseaux d'associations au sein de communautés bactériennes : Inférence de réseaux et distribution en loi de puissance de l'abondance des espèces - Arnaud Cougoul, Unité d'Epidémiologie Animale, Clermont-Ferrand-Theix | |
11:30 - 12:00 | › Modélisation Bayésienne de réseaux Biologiques - Ghislaine Gayraud, Laboratoire de Mathématiques Appliquées de Compiègne | |
12:00 - 12:30 | › Régression binomiale négative avec termes d'interaction: un modèle pour étudier le lien entre protéines et boucles ADN - Raphaël Mourad, Laboratoire de biologie moléculaire eucaryote du CNRS, Toulouse | |
12:30 - 14:30 | Repas puis Discussions libres / AG MOABI-NETBIO-AIGM | |
14:30 - 15:30 | Tutoriel : Méthodes exactes d'optimisation pour l'apprentissage de la structure de réseaux Bayésiens en vue de reconstruire des réseaux de régulations de gènes - Simon de Givry, MIAT INRA Toulouse | |
15:30 - 16:00 | Pause | |
16:00 - 17:00 | Learning microbial networks from NGS data: a case example - Corinne Vacher, BIOGECO INRA Bordeaux |
vendredi 14 octobre 2016
Heures | événement | |
09:00 - 10:00 | Dynamic optimization of metabolic networks coupled with gene expression - Alexander Bockmayr, Freie Universität Berlin | |
10:00 - 11:00 | Travaux génériques / Applications / Nouvelles questions | |
10:00 - 10:30 | › Exact Bayesian inference for off-line change-point detection in tree-structured graphical models - Loïc Schwaller, AgroParisTech | |
10:30 - 11:00 | › Identification of deregulated transcription factors in bladder cancer - Magali CHAMPION, Laboratoire de Mathématiques Appliquées, Paris 5 | |
11:00 - 11:30 | Pause | |
11:30 - 12:30 | Inferring and analysing the gene regulatory networks involved in plant root development - Soazig Guyomarch, Université de Montpellier | |
12:30 - 13:30 | Repas (picnic, sur place ou à emporter) |