L'objectif du colloque CARTABLE est de réunir des chercheurs biologistes et écologues et des chercheurs en informatique, statistique (au sens large) pour discuter des enjeux actuels de l'apprentissage de réseaux moléculaires et de réseaux écologiques. Le colloque permettre de confronter ces défis aux avancées actuelles de la théorie et l'algorithmique sur l'apprentissage de structure de graphes : Quelles sont les approches habituelles pour inférer des réseaux ? Peut-on utiliser les mêmes approches pour apprendre un réseau moléculaire et un réseau écologique ? Quelles sont les spécificités de ces réseaux, des données disponibles ? Que permettent de faire les méthodes et algorithmes actuels ? Quels sont les verrous à lever ?

Le format se veut favorable au partage des questions et aux discussions, avec des tutoriels à la fois sur les applications et les méthodes, une session posters et l'organisation d'une table ronde.

Ce colloque est organisé conjointement par les réseaux méthodologiques AIGM, NETBIO et Optim du département Mathématiques et Informatique Appliquées de l'INRA. Il s'inscrit dans le cadre du semestre thématique "Mathématiques et Informatique pour la Biologie, organisé par le CIMI.

Avec le soutien de David Allouche, Julien Chiquet, Marie-Josée Cros, Simon de Givry, Evelyne Lutton, Marie-Laure Martin-Magniette, Nathalie Peyrard, Stéphane Robin, Régis Sabbadin, Mathieu Serrurier, Thomas Schiex.

L'inscription est gratuite mais obligatoire (et vous engage ! ) et se fait via https://cartable.sciencesconf.org  (après avoir créé un compte, c'est rapide). Le nombre de places est limité. [Inscriptions closes !]

Sont attendues des communications :

• sur des travaux génériques sur l'apprentissage de la structure de graphe, quelque soit le cadre méthodologique (réseau bayésien, réseau bayésien dynamique, logique, champs gaussiens, Lasso …). Les contributions peuvent porter sur les aspect optimisation, algorithmique, le traitement des données manquantes, hétérogènes, dynamiques … ;
• sur des applications  de ces méthodes à l'apprentissage de réseaux moléculaires ou de réseaux écologiques (prioritairement, mais des présentations sur d'autres applications ne sont pas exclues si elles apportent un éclairage sur de nouvelles méthodes) ;
• sur des présentations de nouvelles questions d’apprentissage  de réseaux moléculaires ou écologiquesmoléculaires ou écologiques.

Les communications seront de deux types : communication orale ou poster. Le comité d'organisation décidera de l'un ou l'autre des formats en fonction des soumissions.

Les soumissions sont à faire sous la forme d'un résumé d'une page, à transmettre via le site web du colloque (après avoir créé un compte).

Date limite de soumission d'un résumé : 9 septembre 2016.

Notification : 19 septembre 2016.

Réseau INRA AIGM (Algorithmic issues for Inference in graphical Models)

Réseau INRA NETBIO (Inférence de réseaux biologiques)

Réseau INRA Optim (Optimisation pour les sciences de la vie)   

IMABS (Pôle toulousain d'Animation des Maths-Info du Centre INRA Midi-Pyrénées) INRA (Institut National de la Recherche Agronomique)

GdR BIM (GdR de Bioinformatique Moléculaire)

GdR Stat et Santé