Programme
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événement |
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09:45 - 10:00
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Introduction |
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10:00 - 11:00
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Tutoriel : Learning ecological networks – benefits and perspectives - Dave Bohan, UMR Agroecologie INRA Dijon |
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11:00 - 11:30
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Pause |
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11:30 - 12:30
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Tutoriel : apprentissage de réseaux biologiques - Guillem Rigaill, SPS Paris Saclay |
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12:30 - 14:00
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Repas puis Discussion libres / AG AIGM |
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14:00 - 15:00
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Sobol sensitivity analysis. Recent statistical result overview. Kick and follow for network construction - Fabrice Gamboa - Université Paul Sabatier, Toulouse |
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15:00 - 15:30
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Pause |
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15:30 - 17:00
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Travaux génériques / Applications / Nouvelles questions |
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| 15:30 - 16:00 |
› Learning the structure of kelp forest ecological network - Etienne Auclair, Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse |
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| 16:00 - 16:30 |
› Impact de l'échantillonnage sur l'inférence de structure dans les réseaux - Timothée Tabouy, Mathématiques et Informatique Appliquées, Paris-Saclay |
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| 16:30 - 17:00 |
› Inférence et clustering de graphes pour l'exploration du microbiote intestinal humain - Hanna Julienne, MetaGénoPolis, INRA, Université Paris-Saclay |
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| Heures |
événement |
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09:00 - 10:00
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Tutoriel : statistique et apprentissage de réseau - Julien Chiquet, UMR AgroParisTech INRA MIA Paris |
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10:00 - 10:30
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Pause |
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10:30 - 12:30
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Travaux génériques / Applications / Nouvelles questions |
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| 10:30 - 11:00 |
› Inférence de réseaux parcimonieux en présence de variables inobservées - Geneviève Robin, Mathématiques et Informatique Appliquées, AgroParisTech |
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| 11:00 - 11:30 |
› Réseaux d'associations au sein de communautés bactériennes : Inférence de réseaux et distribution en loi de puissance de l'abondance des espèces - Arnaud Cougoul, Unité d'Epidémiologie Animale, Clermont-Ferrand-Theix |
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| 11:30 - 12:00 |
› Modélisation Bayésienne de réseaux Biologiques - Ghislaine Gayraud, Laboratoire de Mathématiques Appliquées de Compiègne |
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| 12:00 - 12:30 |
› Régression binomiale négative avec termes d'interaction: un modèle pour étudier le lien entre protéines et boucles ADN - Raphaël Mourad, Laboratoire de biologie moléculaire eucaryote du CNRS, Toulouse |
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12:30 - 14:30
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Repas puis Discussions libres / AG MOABI-NETBIO-AIGM |
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14:30 - 15:30
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Tutoriel : Méthodes exactes d'optimisation pour l'apprentissage de la structure de réseaux Bayésiens en vue de reconstruire des réseaux de régulations de gènes - Simon de Givry, MIAT INRA Toulouse |
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15:30 - 16:00
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Pause |
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16:00 - 17:00
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Learning microbial networks from NGS data: a case example - Corinne Vacher, BIOGECO INRA Bordeaux |
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| Heures |
événement |
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09:00 - 10:00
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Dynamic optimization of metabolic networks coupled with gene expression - Alexander Bockmayr, Freie Universität Berlin |
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10:00 - 11:00
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Travaux génériques / Applications / Nouvelles questions |
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| 10:00 - 10:30 |
› Exact Bayesian inference for off-line change-point detection in tree-structured graphical models - Loïc Schwaller, AgroParisTech |
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| 10:30 - 11:00 |
› Identification of deregulated transcription factors in bladder cancer - Magali CHAMPION, Laboratoire de Mathématiques Appliquées, Paris 5 |
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11:00 - 11:30
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Pause |
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11:30 - 12:30
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Inferring and analysing the gene regulatory networks involved in plant root development - Soazig Guyomarch, Université de Montpellier |
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12:30 - 13:30
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Repas (picnic, sur place ou à emporter) |
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